1.Beining Zhang、Xingjun Hu（共同第一作者）、Chunxiang Li，《Revisiting the dispersal history of walnut (Juglans regia) via analyzing the ancient DNA of walnut remains in Xinjiang of China》《Cell report》2025年12月，SCI I区 2.胡兴军等，《新疆尉犁县克亚克库都克唐代烽燧遗址》《考古》2021年第8期，CSSCI，北大核心 3.胡兴军，《新疆尉犁克亚克库都克烽燧遗址出土唐《横岭烽状上通海镇为楼兰路截踪事》文书》《文物》2023年第3期，CSSCI，北大核心 4.胡兴军，《新疆洛浦县比孜里墓地M36出土彩绘木棺考释》《考古与文物》2024年第4期，CSSCI，北大核心 5.胡兴军，《新疆尉犁县克亚克库都克烽燧遗址出土《韩朋赋》释析》《西域研究》2021年第2期，CSSCI 6.胡兴军，《新疆尉犁克亚克库都克烽燧遗址出土勋告文书初步研究》《西域研究》2024年第1期，CSSCI 7.胡兴军，《考古展示1200年前唐代戍边生活》《人民日报》2022年1月15日第6版。 8.胡兴军，《新疆尉犁县克亚克库都克烽燧文书所见“野麻”考》《农业考古》2024年第6期，北大核心 9.王栋、温睿、朱瑛培、胡兴军等，《新疆尉犁县营盘墓地出土夹金属箔层玻璃珠研究》《考古与文物》2022年第4期，CSSCI，北大核心 10.李敬朴、胡兴军等，《新疆出土唐代葫芦的有机残留物分析》《中国科技史杂志》，2022年第4期，CSSCI，北大核心 11.胡兴军、阿里甫，《洛浦县比孜里墓地考古新收获》《西域研究》2017年第1期，CSSCI 12.胡兴军、何丽萍，《新疆尉犁县咸水泉古城的发现与初步认识》《西域研究》2017年第2期，CSSCI 13.农旷远、胡兴军等，《新疆克亚克库都克唐代烽燧遗址木炭记录的薪柴利用和植被生态》《第四纪研究》2022年1月，北大核心 14.肖琪琪、胡兴军等，《新疆洛浦县比孜里墓地出土食物遗存的科技分析》《第四纪研究》2020年第2期，北大核心 15.侯明明、胡兴军，《吐鲁番发现的“大随求陀罗尼经咒图”研究》，《青海民族研究》，2024年第2期，CSSCI，北大核心 16.黄有良、胡兴军等，《新疆克亚克库都克唐代烽燧遗址粪化石脂质记录的动物利用》《地理科学》2024年11月第11期第44卷，CSSCI 17.梅建军、凌勇、陈坤龙、伊第利斯、李文瑛、胡兴军，《新疆小河墓地出土部分金属器的初步分析》《西域研究》2013年第1期，CSSCI 18.胡兴军等，《新疆尉犁咸水泉古城考古调查简报》《考古与文物》2025第7期，CSSCI，北大核心 19.胡兴军等，《新疆沙湾宁家河水库墓地发掘简报》《文物》2020年第4期，CSSCI，北大核心 20.伊弟利斯、李文瑛、胡兴军，《2003年罗布泊小河墓地发掘简报》《文物》2007年第10期，CSSCI，北大核心 21.阮秋荣、胡兴军等，《乌鲁木齐萨恩萨依墓地发掘简报》《文物》2012年第5期，CSSCI，北大核心） 22.于建军、胡兴军等，《新疆布尔津喀纳斯下湖口图瓦新村墓地发掘简报》《文物》2014年第7期，CSSCI，北大核心 23.于建军、胡兴军等，《新疆哈巴河托干拜2号墓地发掘简报》，《文物》，2014年第12期，CSSCIⅡ区，北大核心 24.阿里甫、胡兴军等，《新疆吉木乃县219国道沿线墓地考古发掘报告》《边疆考古研究》第28辑，CSSCI 25.胡兴军等，《裕民县阿勒腾也木勒水库墓地发掘简报》《边疆考古研究》第21辑，CSSCI 26.胡兴军等，《新疆若羌县瓦石峡墓地考古发掘简报》《文博》2021年第1期，北大核心 | 
